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Text File  |  1995-03-04  |  1.6 KB  |  38 lines
  1. ********************************************************
  2. * Glycosyl hydrolases family 25 active sites signature *
  3. ********************************************************
  4.  
  5. It has  been shown [1,2] that a number of cell-wall lytic enzymes (EC 3.2.1.17
  6. and EC 3.5.1.28) are  evolutionary related and can be classified into a single
  7. family:
  8.  
  9.  - N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase (muramidase) (lysin)  from Streptococcus
  10.    pneumoniae bacteriophages of the Cp family.
  11.  - Autolytic lysozyme from Clostridium acetobutylicum.
  12.  - Lysozyme (endolysin) from Lactococcus delbrueckii phage mv1.
  13.  - Lysozyme M1 from Streptomyces globisporus.
  14.  - N,O-diacetylmuramidase (lysozyme ch) from the fungus Chalaropsis.
  15.  
  16. Two residues,  an  aspartate    and  a  glutamate,  have  been shown [3] to be
  17. important for the catalytic activity of the Charalopsis enzyme. These residues
  18. as well  as  some  others in their vicinity are conserved in all proteins from
  19. this family and can be used as a signature pattern.
  20.  
  21. -Consensus pattern: D-[LIVM]-x(3)-[NQ]-[PG]-x(9,10)-G-x(4)-[LIVMFY](2)-K-x-
  22.                     [ST]-E-[GS]-x(2)-Y-x-[DN]
  23.                     [D and E are active site residues]
  24. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  25. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  26.  
  27. -Expert(s) to contact by email: Henrissat B.
  28.                                 bernie@cermav.grenet.fr
  29.  
  30. -Last update: June 1994 / First entry.
  31.  
  32. [ 1] Croux C., Garcia J.L.
  33.      Gene 104:25-31(1991).
  34. [ 2] Henrissat B.
  35.      Biochem. J. 280:309-316(1991).
  36. [ 3] Fouche P.B., Hash J.H.
  37.      J. Biol. Chem. 253:6787-6793(1978).
  38.